2.宫外孕。一般人群宫外孕的发生率为1%到2.5%。虽然IVF是将胚胎移植到子宫内，但由于输卵管趋化因子对胚胎的影响，胚胎会游走到输卵管内，在输卵管内着床、发育，造成宫外孕。有时胚胎还会种植在宫颈等部位。因此，接受IVF治疗并不能防止宫外孕的发生。
3.多胎妊娠。这个很多时候都是夫妻双方希望能够怀上多胎的情况造成的。多胎妊娠晚期流产和早产的风险显著高于单胎妊娠，母亲患妊娠期糖尿病、妊娠期高血压病、发生难产和产后出血的风险显著增加。因此，多胎妊娠对母儿都不利。对于三胎或三胎以上妊娠者，必须进行减胎，而对于双胎妊娠者，建议患者减胎。
4.卵巢过度刺激综合征。这是使用促排卵药物不当的情况下出现的。由于多个卵泡生长，导致体内雌激素水平超高，使得血管通透性增加，血管内液体漏到腹腔，甚至胸腔内，引起胸腹水。发生率约为10%。多数人症状较轻，表现为腹胀、腹部不适、轻度恶心；但少数人会出现严重腹胀、少尿、腹痛、纳差，甚至出现胸闷、气短等症状。
以上四种情况，除了宫外孕外，其它三种情况都是可以得到控制的。宫外孕完全是自然情况下发生的，就像是自然孕育过程中概率差不多。但是，试管婴儿医生会在胚胎移植的时候，将胚胎放在一个便于着床的位置。这样就可以减少宫外孕的产生。
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