试管婴儿技术对后代是否有影响，当然要靠事实数据说话。近年来全球范围内一些较大规模的调查研究显示由试管婴儿技术出生的子代与自然受孕出生的子代在出生缺陷、生理发育、智商等方面并无显着差异。也有研究发现试管婴儿中，低出生体重风险增加，试管后代长大后超重、性早熟的患病率等略高于自然受孕的后代。但这些不利的风险很可能是由不孕夫妇年龄偏大以及导致不孕的疾病本身所造成的，并不一定归结于试管婴儿技术本身。
此外，二代试管婴儿技术，即在显微镜下选择一条精子，用细针直接送进卵胞浆内完成受精，该技术助孕产生的后代出生缺陷、生育力障碍的风险可能略高于自然受孕诞生的后代。需要二代试管技术帮助的夫妇，多存在男性精子密度、活力严重不足的问题，通过该技术可能使一些看似正常但仍存在问题的精子规避了自然淘汰，造成了上述不良风险。而第一例试管婴儿技术诞生的女孩路易斯在2006年自然受孕产下一健康男婴，2016年我国首例供胚移植试管婴儿罗优群的爱人自然受孕产下一健康的女婴，这宣告着试管婴儿和正常人一样能够自然生育健康宝宝。“不孕夫妇通过试管技术获得的后代也将不孕”的说法不攻自破。
试管婴儿技术的前阶段大都需要用药物促排，使一个月经周期中有多个卵泡生长。有些姑娘会有这样的顾虑：一下子消耗掉那么多卵子，卵巢会不会迅速衰老，是不是会提前绝经。首先要说明这样一个事实：正常的一个月经周期，虽然只有一个卵泡最终发育成熟排卵，但在周期早期卵巢中有一批卵泡被募集、生长，其中大部分在竞争中失败而死亡；试管婴儿技术中的药物促排则是让这些走向死亡的卵泡均有机会成长并成熟。因此，药物促排的月经周期虽然得到了数个卵子，但消耗的卵子数目并不比自然周期多，对卵巢的功能并无明显影响。
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