流感大流行是新型甲型流感病毒的全球暴发。当新型甲型流感病毒出现时，就会发生大流行，这些病毒能够轻易感染人，并以有效和持续的方式在人与人之间传播。自1997年香港录得禽流感个案以来，已经过去了二十年，而自2009年最近一次流感大流行以来，已经过去了十年。甲型H5N1和甲型H7N9流感感染的零星病例一直在积累， 必须为这些毒株或其他可能发展为流感大流行并在全球传播的新型流感毒株做好准备，例如甲型H1N1 pdm09。流感大流行可引起严重肺炎，产生耐药病毒，并使抗病毒药物在接受奥司他韦或巴洛沙韦治疗的患者长期病毒生长期间无效。法匹拉韦作为抗流感药物的这一突出特点已被利用在中国与奥司他韦联合治疗重症流感患者。
尽管耐药病毒的生长能力可能降低，但许多患者使用药物继续承受选择压力，以确保耐药病毒占主导地位。药物选择仍在继续，耐药菌株在大流行期间占主导地位，因为许多接受相同抗流感药物治疗的患者选择了耐药菌株。关于具有良好复制能力的耐药病毒，具有NA H275Y替代的奥司他韦耐药甲型（H1N1）病毒在2008年至2009年季节在全球范围内传播。因此， 有奥司他韦耐药菌株全球大流行的经验。法匹拉韦从大流行的第一个患者到最后一个患者保持相同的功效，因为它的耐药菌株不会出现或不能取代原始菌株。
法匹拉韦在治疗具有高病毒载量特征的严重流感感染小鼠方面明显比奥司他韦更有效，并且在治疗期间不会出现法匹拉韦耐药病毒。
与奥司他韦单药治疗相比，法匹拉韦和奥司他韦联合治疗加速了重症流感的临床恢复。上述研究中使用的法匹拉韦剂量为第1天每天两次1600mg，然后是600mg，每天两次，持续9天，日本批准的法匹拉韦剂量为1600mg，每天两次，在第1天，然后每天两次，持续4天，每次600mg。季节性流感的病毒复制期为6天或更长时间。当在病毒复制期间停止给药或出现耐药菌株时，病毒复制和发烧复发。因此，严重流感或新型流感可能需要10天的给药。
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