胃肠道反应是二甲双胍常见的不良反应，包括恶心呕吐、腹泻、食欲下降等，多出现在治疗的早期，绝大多数发生于前10周。对此，随着治疗时间的延长，患者可以逐渐耐受或症状消失，不必立即停药。其实，对于二甲双胍的胃肠道反应，有办法减轻甚至避免，比如用药从小剂量起始，逐渐加量，慢慢达到每天2000毫克这个最佳剂量。
另外，二甲双胍普通片放在餐中或餐后服用，或服用二甲双胍缓释制剂、肠溶制剂。 二甲双胍剂量增加的过程中，降糖效果也会增强，糖友需注意监测血糖。
二甲双胍通过胃肠道吸收进入血液循环，不经过肝脏代谢，主要由肾脏从尿中排出，清除迅速，12～24小时大约可清除90%。因此，二甲双胍本身无肝肾毒性，不会损伤肝肾，伤肝肾之说纯属谬论。
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