最常见舒尼替尼不良反应(≥20%)是疲乏，虚弱，发热，腹泻，恶心，粘膜炎/口炎，呕吐，消化不良，腹痛，便秘，高血压，周边水肿，皮疹，手-足综合征，皮肤脱色，干皮肤，毛发颜色变化，味觉变化，头痛，背痛，关节痛，肢体痛，咳嗽，呼吸困难，厌食，和出血。
如酮康唑，可增加舒尼替尼的血浆浓度。建议选择对此类酶没有或只有最小抑制作用的合并用药。如果必须与CYP3A4 强抑制剂同时应用时，需要考虑降低本品剂量。健康志愿者服用单剂量苹果酸舒尼替尼，同时给予CYP3A4 强抑制剂（酮康唑），可导致总体（舒尼替尼及其主要活性代谢产物）的Cmax 和AUC0-∞分别增加49% 和51% 。
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