在临床上约40%－75％急性丙型肝炎病毒感染者无任何不适症状，只有血清ALT升高患者在求治其他疾病或体检时才被意外发现，或因有输血史、注射史，就医时由于医生警惕性高，检测出抗-丙型肝炎病毒 阳性和ALT升高而被发现。临床表现一般较轻，被称为亚临床型。有一半患者可自行康复。但再次暴露于丙型肝炎病毒后，又会重新感染。感染丙型肝炎病毒后，会出现周身不适、乏力、食欲减退、偶有恶心，少数患者有肝区疼痛，黄疸等典型急性肝炎的症状。但总的来说，出现黄疸的病例很少，即使有黄疸也相对较轻。ALT可正常或仅仅有轻度升高，部分患者ALT持续升高。一般将其分为3个类型。
1、反复发作型。此型为典型的丙型肝炎病毒感染表现。ALT高于正常值，在正常值上下反复波动，时高时低，缓解期时ALT可恢复正常，肝活检结果表明，患者肝炎病变的严重程度不等。2、持续异常型。此型的ALT呈持续性升高，但ALT的数值仅比正常值高1－2倍左右。肝活检同样显示病变轻重程度不等的慢性肝炎改变。持续型和反复发作型，在急性期和慢性期感染均可见到。
3、健康携带型。此型ALT正常，肝活检可能正常或显示不同程度的慢性肝炎改变。由于健康携带者仍可能存在病毒血症，所以ALT正常并不能否定慢性丙型肝炎的可能。部分病例常与乙型肝炎病毒重叠感染，症状较单纯丙型肝炎感染重。感染的严重程度往往与输多份血、输血量大、输入的血中肝炎病毒复制活跃有关，接受血者有可能患急性肝坏死或亚急重型肝炎，预后差，病死率高。
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