HCV抗体检测：诊断丙型肝炎从抗体测试开始。通常在病毒进入体内后的两三个月内，可以在血液中检测HCV抗体。如果一个人对HCV抗体阳性，他或她过去已经暴露于病毒。最初感染HCV的人中有大约15％至25％能够通过身体暴露6个月内清除病毒，因此下一步是使用病毒载量测试来查找血液中的实际病毒。如果一个人有急性感染，意味着他或她最近感染了HCV，那么抗体可能还没有形成，所以需要病毒载量来确认感染。
HCV病毒载量测试：医疗保健提供者可以要求进行定性HCV RNA检测，以确定病毒是否在人的血液中。医疗机构还可以订购定量的HCV RNA检测结果，以确定一个人的HCV病毒载量（血液中HCV的量）。使用各种方法检测HCV RNA，包括TMA（转录介导的扩增），PCR（聚合酶链反应）和bDNA（支链DNA）。定性病毒载量测试往往比定量测试更敏感。使用PCR或TMA的病毒载量测试比bDNA测试更敏感。
治疗期间使用HCV病毒载量测试来确定药物的运行情况。HCV RNA的增加和减少与疾病进展无关，因此定性病毒载量测试在治疗之外不是很有用。HCV病毒载量结果无法确定丙型肝炎患者是否或何时发生肝硬化或肝功能衰竭。
HCV基因型检测：基因型是指生物体的遗传结构或构成。丙型肝炎病毒有七种不同的基因型，按照发现的顺序编号。这些基因型中的每一种都具有亚型，它们以被发现的顺序排列。找出哪种丙型肝炎基因型是重要的，因为它决定了你最好的治疗方法。HCV基因型也有助于预测治愈HCV的可能性，但是治愈率高的药物的改善使得这不太有用。
全球HCV基因型1最常见，占46％。在美国，75％的HCV感染是基因型1;基因型2,3和4在美国较不常见，其他基因型很少见。基因型7在2013年被发现，只有一个已知病例。可能感染多种HCV基因型;这是注射吸毒者和1987年以前（病毒灭活开始时）接受过污染血液制品的人员，或在1992年7月之前进行有效筛选手术的输血者。
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