一、关节炎和关节痛。慢性HCV感染者常见有风湿性疾病表现，如关节痛和关节炎，其病理机制可能是HCV 直接侵袭滑膜细胞或细胞因子诱导关节损伤。HCV 感染者中有40%～80%合并关节痛，而关节炎的发生率不足10% ，前者主要累及膝关节和手关节，为对称性、非畸形疼痛。HCV 感染关节受累分两大类：第一类是非侵蚀性单关节炎，主要累及中、大关节，呈间断性发作，常与冷球蛋白血症相关；第二类是多关节炎，主要累及小关节，与类风湿性关节炎症状相似，症状轻微。HCV 相关性关节炎中50% ～ 80%的患者血清类风湿性因子阳性，而抗环状瓜氨酸肽抗体多为阴性，可与类风湿性关节炎相鉴别。治疗HCV 使用的IFN有可能加重关节痛或肌痛，故优先选用无IFN抗病毒药物。
二 干燥综合征。20%～30%的HCV 感染者存在眼干或口干症状，50%可出现慢性淋巴细胞性腮腺炎，而干燥综合征患者中HCV 血清学阳性率仅有5%，提示HCV 感染与干燥综合征具有一定的相关性。HCV 相关干燥综合征需要与原发性干燥综合征相鉴别，前者抗ssA、抗ssB抗体缺如或呈低效价，而类风湿性因子和冷球蛋白阳性。HCV相关干燥综合征缺少有效药物，抗病毒治疗即使达到持续病毒应答也难以改善干燥综合征症状。
三、肾脏疾病。HCV相关性肾病最常见的病理类型是Ⅱ型冷球蛋白血症性膜增生性肾小球肾炎（MPGN），其他少见的病理类型包括膜性肾小球肾炎、局灶节段硬化性肾小球炎、无冷球蛋白血症性MPGN 等。HCV 感染相关的肾脏疾病的发病机制可能与免疫复合物或原位免疫复合物在毛细血管壁、基底膜内或肾小管间质等部位沉积有关，其通过激活补体和细胞因子，诱发免疫介导的炎症反应而损伤肾脏。此外，HCV感染导致的自身免疫反应亦可直接引起肾组织损伤。
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