近年来，随着越来越多的直接抗病毒药上市，索非布韦已经逐渐摆脱与副作用较多的干扰素或/和利巴韦林联合应用，与新一代治疗丙型肝炎的直接抗病毒药物联合，疗效更好且更安全。比如：索非布韦与雷迪帕韦联合治疗基因1，4，6型丙肝；索非布韦与达卡它韦联合治疗基因2，3型丙肝。这些治疗方案使丙肝患者得到更安全有效的治疗。索非布韦治丙肝效果虽好，但是要掌握正确的用药方法。
索非布韦的推荐剂量为400 mg，每日1次口服。它的吸收率和生物利用度不受食物影响，因此不必像蛋白酶抑制剂那样要求在进餐前后服用。但与高脂饮食同时服用可减慢药物的吸收，因此最好空腹服药。索非布韦主要通过肾脏排泄，治疗期间应注意监测肾功能。少数药物与索非布韦有相互作用，如：抗癫痫药(如卡马西平、苯妥英钠、苯巴比妥、奥卡西平)、抗结核药(如利福布丁、利福平、利福喷丁)、抗艾滋病病毒的蛋白酶抑制剂(如替拉那韦、利托那韦)
上述药物与索非布韦合用，可降低索非布韦的血药浓度，影响其抗病毒疗效。2015年3月，美国FDA收到9例服用胺碘酮治疗的患者在使用含有索非布韦方案的药物治疗丙型肝炎后发生严重的心动过缓，其中1例心脏停搏死亡，3例需要安装起搏器治疗。因此，美国FDA发出警告，索非布韦与胺碘酮可能有相互作用，导致索非布韦的血药浓度增加，引起心脏毒性。
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