HCV丙肝感染的发病机制主要包括免疫介导和HCV直接损伤两种，丙肝病毒因素包括病毒的基因型、复制能力、病毒多肽的免疫原性等；宿主因素包括人体的先天性免疫反应、体液免疫和细胞免疫反应等。饮酒、免疫抑制剂的使用等因素对HCV的感染病程也有影响。
丙肝的传播途径主要是：1、丙肝病毒通过血液进行传播。这是丙肝病毒最主要的传播方式，主要是通过献血员和血液制品进行传播。2、垂直传播，主要指的是丙肝病毒的母婴垂直传播，携带丙肝病毒的女性在分娩过程中容易将丙肝病毒传染给婴儿。接吻、拥抱、喷嚏、咳嗽、食物、饮水、共用餐具和水杯、无皮肤破损及其他无血液暴露的接触一般不传播HCV。输入含HCV或HCV-RNA的血浆或血液制品，一般经6-7周潜伏期例急性发病，临床表现全身无力，胃纳差，肝区不适，1/3病人有黄疸，ALT升高，抗HCV抗体阳性。临床丙型肝炎病人50%可发展为慢性肝炎，甚至部分病人会导致肝硬及肝细胞癌。其余约半数病人为自限性，可自动康复。
医学界目前还没有研制出有效预防丙肝的疫苗，因为丙肝病毒是RNA病毒，非常的容易变异，研制疫苗的难度会很大，而且除了人和黑猩猩以外，其他动物都不会患上丙肝，因此疫苗研制难以找到合适的动物模型，所以惟一的有效的解决方法是高危人群要及早做丙肝抗体的检测，及早发现此类型的疾病并积极治疗。
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