丙型肝炎疫苗的发展开始于20多年前。在丙型肝炎病毒刚被鉴定出来之后，研究人员研究了几种潜在的动物疫苗。丙肝疫苗进展缓慢主要因为丙肝病毒的独特特性丙型肝炎病毒相比甲肝病毒乙肝病毒来说更加可变。丙型肝炎病毒至少有6种基因型，并且有多种亚型。目前已经确定的有50多种亚型。1型丙肝在美国和欧洲比较常见。3型丙肝在印度、远东和澳大利亚比较常见。而第四类在非洲和中东是比较常见的。丙肝疫苗必须免疫所有这些病毒的变种。
有限的动物模型丙肝病毒可以感染黑猩猩，而黑猩猩于成年人是相似的。但是，伦理和费用问题限制了这些动物的医学研究进展。在过去的十年中，接种人体肝细胞的转基因小白鼠被证明是研究丙型肝炎感染的最右价值模型。在丙肝疫苗试验中难以招收危险人群查明疫苗是否能够预防感染的唯一方法就是在高风险人群中进行测试。在发达国家，感染丙肝风险最高的人群是使用针头注射毒品的吸毒人员。但吸毒人员通常避免去医院，并且难以和他们保持联系。在发展中国家，更多的人群面临丙肝的威胁。在这些国家，一些医院违规操作，而在一些国家，缺乏医疗设施及专业的医护人员，也使得丙肝疫苗试验变得非常困难。
缺少明确的保护标记当你感染过甲肝或乙肝后，你的免疫系统将会“记住”病毒，并且防止再次感染。甲肝乙肝疫苗就是通过激发病毒的保护性记忆从而不引起疾病来产生预防作用。丙肝的感染是不同的，在那感染多年之后才会导致严重的问题。而在这期间，病毒逃脱了身体的免疫防御。尽管如此，丙肝虽无疫苗，但却有可以治疗丙肝的药物。自丙肝口服直接抗病毒药物问世以来，丙肝患者可以放弃干扰素等传统疗效差的方案，通过口服药物来进行治疗。而该类型抗病毒药已经进展到了第三代，即针对所有丙肝基因分型都有效，丙肝治疗前无需再分型。
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