索磷布韦（sofosbuvir）属于核苷类聚合酶抑制剂，但它不抑制人类DNA和RNA聚合酶，也不是线粒体RNA聚合酶的抑制剂，不良反应少见。在动物试验中，索磷布韦（sofosbuvir）没有遗传毒性和生殖毒性，属于妊娠期安全程度B级药物。索磷布韦（sofosbuvir）单药治疗12周的临床试验中未发现与药物相关的不良反应。
在Ⅱ期和Ⅲ期临床试验中患者耐受性好，少数患者有轻度疲劳和头痛，罕见有肌酸激酶和脂肪酶轻度升高，但没有影响临床治疗。索磷布韦（sofosbuvir）联合干扰素和利巴韦林治疗期间的不良反应一般都是由聚乙二醇化干扰素或/和利巴韦林所致。
即使索磷布韦（sofosbuvir）与聚乙二醇化干扰素或/和利巴韦林联合治疗，由于大大缩短了疗程，患者的治疗依从性也明显优于聚乙二醇化干扰素联合利巴韦林方案，因不良反应而中断治疗的患者明显减少。
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