核小体向高级染色质结构的组装可通过组蛋白对分子伴侣和核小体结合位点的相对亲和力进行微调。髓样白血病蛋白SET /TAF-Iβ属于组蛋白伴侣NAP1家族,并参与几种基于染色质的机制,例如染色质组装,核小体重组和转录激活。为了更好地了解SET /TAF-Iβ的组蛋白伴侣功能,我们设计了几种SET/TAF-Iβ截短体,通过圆二色性检查了其结构完整性,并使用GST定性和定量评估了野生型蛋白和突变体形式的组蛋白结合特性。 下拉实验和基于荧光光谱的结合测定。
野生型SET /TAF-Iβ以2.87和0.15μM的Kd值分别结合组蛋白H2B和H3。SET/TAF-Iβ与组蛋白H3的优先结合由其中心区域和H3的球状部分介导。相反,SET /TAF-Iβ的酸性C末端尾端和氨基末端二聚结构域以及H3氨基末端尾端对于该相互作用是必需的。这种类型的分析使我们能够评估SET /TAF-Iβ对不同组蛋白的相对亲和力,并鉴定有效组蛋白识别所需的蛋白质结构域。我们的发现与SET/TAF-Iβ的最新结构研究一致,并且对于理解SET /TAF-Iβ在染色质功能中的作用可能是有价值的。
真核细胞的基因组组织为染色质,染色质是DNA和组蛋白之间的高度动态复合体。染色质中的基本重复单元是核小体核心颗粒(NCP),它由147bpDNA包裹在八聚体核心周围,该八聚体核心包含四个组蛋白H2A,H2B,H3和H4的两个拷贝。最终,将核小体的长阵列进一步压实成形成功能性染色质结构域的高级结构。将DNA包装到染色质中可确保基因组稳定性,但同时也为细胞因子接近基本DNA序列创造了障碍,从而影响了基因表达,DNA复制,重组和修复。调节染色质结构的主要机制包括ATP依赖性核小体重塑复合物,组蛋白的共价修饰,组蛋白变体交换和组蛋白伴侣。 ATP依赖的重塑复合物利用ATP水解的能量来调节染色质的流动性,从而导致转录的激活或抑制。最近的研究表明,大量的翻译后修饰位于柔性组蛋白尾部或组蛋白球状结构域中,它们与染色质的不同功能状态相关。与这些机制一致,非组蛋白和组蛋白分子伴侣通过影响组蛋白对DNA的结合亲和力来调节核小体动力学。
组蛋白伴侣是染色质结构域的关键参与者。它们屏蔽了组蛋白的正电荷,并保护它们免受与DNA或其他可能对细胞有害的蛋白质发生不适当的静电相互作用。因此,它们在复制过程中介导染色质的组装/拆卸,组蛋白的存储并协调组蛋白在DNA上的交换/沉积。表征最好的分子伴侣是NAP1,染色质组装因子,核纤溶酶,抗沉默因子(ASF1)。尽管所有分子伴侣均与组蛋白结合,但它们似乎在体内介导不同的蛋白相互作用,其组蛋白伴侣和结合亲和力相差很大。
此处研究的髓样白血病蛋白SET /TAF-1β,也称为I2PP2A和INHAT,属于组蛋白伴侣NAP1家族。它最初被鉴定为急性未分化白血病的易位基因,并在人和小鼠组织中广泛表达。 SET /TAF-Iβ功能的分析具有挑战性,因为它涉及广泛的细胞机制,并且尚不清楚如何在这些不同功能之间切换。 SET /TAF-Iβ是磷酸酶2A(PP2A)的有效抑制剂,可与多种参与细胞周期调控的蛋白质相互作用。此外,SET /TAF-Iβ已被确定为细胞毒性T淋巴细胞(CTL)诱导的细胞死亡的关键因素,表明其在调节细胞凋亡中的作用。除了其参与细胞周期和细胞凋亡的控制外,越来越多的报道描述了SET /TAF-Iβ的染色质相关特性。它刺激腺病毒基因组的DNA复制和转录,并诱导染色质去浓缩。其他研究表明,SET /TAF-Iβ与核小体组蛋白结合,并通过掩盖组蛋白尾巴作为INHAT复合物的成分来抑制组蛋白乙酰化。此外,我们先前已经报道过SET /TAF-Iβ与染色质重塑蛋白原胸腺素α和转录共激活因子CREB结合蛋白(CBP)的相互作用。与上述研究一致,基于DNA微阵列的分析表明SET /TAF-Iβ刺激了基因子集的转录。有趣的是,发现被SET /TAF-Iβ上调的内源基因的转录被组蛋白乙酰化加性地刺激。最近,Ichijo等人显示Set /TAF-Iβ与活化的糖皮质激素受体相互作用,并起配体活化的GR反应性转录阻遏物的作用,这进一步表明该蛋白参与了转录调控。那么taf哪能买到?价格是多少?更多详情可咨询下方微信。
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