达拉非尼(dabrafenib)耐药的分子机制

　　达拉非尼（dabrafenib）耐药是黑色素瘤的一个重要问题，其潜在的分子机制仍不清楚。本研究旨在研究达拉非尼（dabrafenib）耐药的分子机制，探索介导黑色素瘤耐药的关键基因和通路。GSE117666从基因表达综合（GEO）数据库下载，492个黑色素瘤统计数据也从癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载。此外，利用 R 软件和 GEO2R 鉴定了差异表达的 miRNA（DEM）。注释、可视化和综合发现数据库 (DAVID) 和 FunRich 用于执行基因本体论 (GO) 和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 通路富集分析，以确定与黑色素瘤化学抗性相关的潜在通路和功能注释。过滤后选择了9个DEM和872个mRNA。然后，将目标基因上传到 Metascape 以构建蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络。此外，在执行 PPI 网络后筛选了 6 个中枢 mRNA。此外，P< 0.05) 并显示出良好的过度生存风险预测模型的功效。本研究可能为黑色素瘤中达拉非尼（dabrafenib）耐药的调控基因提供更深入的了解。

　　近年来，恶性黑色素瘤的发病率和死亡率逐年上升。与其他实体瘤相比，死亡年龄较低。恶性黑色素瘤除早期手术切除外，缺乏特异性治疗，预后较差。因此，恶性黑色素瘤的早期诊断和治疗极为重要。在这篇文章中，GSE117666并下载了 TCGA 数据库中的 492 个黑色素瘤统计数据以供进一步研究。来自 TCGA 数据库的黑色素瘤统计数据是从 GEO 和 TCGA 数据库中搜索的。9 个 DEM（hsa-miR-510、hsa-miR-503、hsa-miR-513a、hsa-miR-509、hsa-miR-146a、hsa-miR-514b、hsa-miR-584、hsa-miR-126 , 和 hsa-miR-508) 是通过结合两个筛选结果来选择的。其中，某些 miRNA 已被证明会影响肿瘤的增殖、迁移和预后。例如，之前的一项研究报道了 miR-510 通过抑制 lncRNA SNHG15 促进甲状腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭；它还可以作为皮肤黑色素瘤患者的预后生物标志物或潜在治疗靶点 。hsa-miR-146a 控制黑色素瘤微环境中的免疫反应，并可能提供一种新的治疗策略来改善黑色素瘤患者的当前管理。另一项研究还报道了 hsa-miR-126 下调通过上调 ADAM9 和 VEGF-A 导致黑色素瘤中的 dabrafenib 获得性耐药。此外，它可能通过直接调节黑色素瘤中的ADAM9和MMP7发挥抑癌作用。

　　为了了解黑色素瘤中 9 种 miRNA 的调控机制，我们选择了 MiRWalk 的两个筛选结果的交集。过滤后鉴定出872个mRNA。功能注释表明这些miRNA主要与“细胞质”、“质膜”、“细胞核”、“转运”、“细胞生长和/或维持”、“核碱基、核苷、核苷酸和核酸代谢的调节”、 “蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性”、“细胞粘附分子活性”和“鸟苷酸交换因子活性”。DEG 的 KEGG 通路分析揭示了参与“癌症中的通路”、“癌症中的蛋白聚糖”、“癌症中的 microRNA”、“Wnt 信号通路”、“癌症中的中心碳代谢”和“细胞因子-细胞因子受体相互作用”。

　　此外，PPI网络分析表明，包括PABPC4 (Poly(A) Binding Protein Cytoplasmic 4)、JUN (Jun Proto-Oncogene, AP-1 Transcription Factor Subunit)、HSPA1A (Heat Shock Protein Family A (Hsp70) Member 1A)在内的6个hub基因)、GSK3B（糖原合成酶激酶 3 Beta）、RNF4（无名指蛋白 4）和 GAK（细胞周期蛋白 G 相关激酶）可用作具有较高相互作用程度的耐达拉非尼（dabrafenib）黑色素瘤的新靶点。PABPC4 是一种蛋白激酶，可能是对多西紫杉醇耐药性前列腺癌治疗作出反应的有价值的生物标志物来源。至于 HSPA1A，一种诱导型热休克蛋白促进肿瘤细胞生长和存活。它还调整转移过程，包括 EMT 和迁移，并且似乎被 E-钙粘蛋白/连环蛋白的 Hsp70 依赖性异质复合物破坏，其充当相邻细胞之间的锚点。GSK3B，糖原合酶激酶 3，被确定为新的 tivantinib 靶标。它还与黑色素生成的调节有关，药物抑制可通过 Wnt/β-catenin 通路激活增加黑色素生成。至于 RNF4，它是一种 SUMO 靶向泛素连接酶，可稳定一组特定的癌蛋白。它增强肿瘤蛋白活性并作为 Wnt 和 Notch 通路的正反馈激动剂。RNF4也是癌细胞生存所必需的，其过度表达与部分癌症患者预后不良有关。GAK（细胞周期蛋白 G 相关激酶）是一种在各种组织中普遍表达的蛋白质，被确定为负责细胞内黑色素积累的脱靶。它还代表了通过黑色素生物合成途径预防和治疗不规则色素沉着的新可能靶点。

　　此外，9 种 miRNA 与黑色素瘤患者的总生存曲线之间的关系表明，hsa-miR-510、hsa-miR-503 和 hsa-miR-513a 的过表达与总生存期的提高有关。然而，hsa-miR-509、hsa-miR-146a、hsa-miR-514b、hsa-miR-584、hsa-miR-126 和 hsa-miR-508 的表达水平可能与整体患者的生存。同时，通过 ROC 曲线评估 9-miRNA 特征对总生存期的预测能力更好。

　　目前，随着靶向治疗的发展，肿瘤耐药性越来越受到重视。因此，有必要为耐药患者寻找新的生物标志物和治疗方法。我们的研究结果得出结论，这些 miRNA 可能在耐达拉非尼（dabrafenib）的黑色素瘤中发挥重要作用。但是，我们所有的数据都是通过生物信息学分析从GEO和TCGA数据库中获得的，相关样本数量有限；需要进一步的数据分析和临床试验来验证。

　　我们的研究不仅探索了黑色素瘤中达拉非尼（dabrafenib）耐药的某些机制，而且还构建了一个重要的 9-miRNA 风险预测模型来预测总生存期。生物信息学方法用于选择耐达拉非尼（dabrafenib）的黑色素瘤细胞中的 DEM。这些发现显着提高了对黑色素瘤病因和潜在分子事件的理解，候选基因和通路可用作治疗靶点。

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