乙肝病毒不与甲型肝炎、戊型肝炎病毒一样进入人体后会直接破坏肝细胞，进而导致肝脏的损害，乙肝病毒进入人体后并不会直接破坏肝脏细胞，而是可能刺激到机体免疫系统，导致免疫应急反应，继而才会使得肝脏细胞损坏。乙肝携带者一定会发展成为乙肝吗？一些人由于机体免疫系统的问题，导致对进入人体的乙肝病毒无法识别及产生清除乙肝病毒能力的T淋巴细胞，没有发生免疫反应，这样一来，就不会损伤肝细胞，也就更不可能引起起肝炎了，临床上我们称其为慢性乙肝病毒携带者，这类病人并不需要治疗，只需定期监测肝功及肝胆B超即可。
在10%-30%的慢性乙肝病毒携带者中，由于乙肝病毒进入人体后刺激了机体免疫力，之后产生免疫反应，因免疫力不够强大，无法完全清除病毒，就会发展成为慢性乙肝，若这些慢性乙肝携带者没有得到有效的治疗，在5年内有12%到20%的几率，会进展为肝硬化，而这些肝硬化病人在5年内有6%到15%的几率发展成为原发性肝癌，另外20%到23%的人则会发展为失代偿期肝硬化。以当前的医疗水平，每当一位患者确诊为慢性乙肝后，到正规医院积极治疗，进行专业化诊治，完全是可以阻止慢性乙肝向肝硬化、原发性肝癌进展的。
慢性乙肝引起的常见并发症主要有肝源性糖尿病，脂肪肝及慢性乙肝后高胆红素血症等。由于乙肝病毒可通过多种途径传染，患者在就业、升学、婚嫁及其他社交活动方面都会受到严重干扰，加之长期治疗带来的经济压力，患者在心理上存在极大的负担。患者感染HBV并转成慢性乙肝之后，机体会反复清除病毒，长者可持续数年甚至数十年，导致肝组织在受损和修复中不断反复，肝脏产生不同程度的纤维化。由于肝脏组织没有末梢神经分布，很多患者在患病初期感觉不到明显症状，导致病情一再迁延。肝脏在病毒的不断损害下，代偿能力逐渐减弱，一旦出现肝炎活动，极易出现腹水、出血、黄疸、昏迷等严重后果。
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