乙肝两对半是判断是否感染乙肝，区分乙肝“大三阳”和“小三阳”的重要指标，也是指导正常人群强化乙肝疫苗接种的指标。但是，在临床诊疗中常常同时进行乙肝病毒检测（HBV-DNA检测）。这就让很多患者产生不解，为什么已经查了乙肝，还要查乙肝病毒。乙肝两对半检测只是对乙肝病毒标志物的判断，只能判断体内有没有感染过乙肝病毒或者有没有抗体，并不能确诊是乙肝患者、乙肝病毒携带者或者是携带有乙肝病毒的相关疾病，而且对病情轻重的评估、指导用药及疗效监测意义不大。
而乙肝病毒基因（乙肝dna）是乙肝病毒存在和具有传染性的最基本特征指标，乙肝病毒的滴度和阴转情况指导抗病毒治疗和效果评价的硬性指标。当HBV-DNA定量检查值小于1.0x103IU/ml时，表明HBV-DNA为阴性，传染力弱；当HBV-DNA定量检查值大于1.0x103IU/时，表明体内HBV-DNA为阳性，病毒仍然较多，传染力强；HBV-DNA越高，病毒复制越厉害，传染性越强。乙肝dna检测，以准确了解乙肝病毒在体内的含量、乙肝病毒复制情况、是否传染，从而判定患者适合哪一种抗病毒药物；同时联合肝功能检查，尤其转氨酶(ALT)来评估肝脏损伤程度，以此对患者进行抗病毒治疗。抗病毒治疗能够降低患者发生肝硬化或肝癌的风险。
当患者HBV-DNA高载量并伴有转氨酶等肝功能指标的升高时，是抗病毒治疗的最好时期，一般来说转氨酶大于正常值的2倍时，才应考虑治疗；若患者HBV-DNA高载量但是肝功能持续正常时，称乙肝病毒携带者，这种情况下是无需进行治疗的。临床研究发现，即使乙肝e抗原转阴，乙肝患者仍有发生肝硬化和肝癌的危险，这些患者并无明显病症，这种乙肝e抗原阴性但仍然活跃的肝炎被称为慢性乙肝再活跃期，如果持续时间超过半年很可能说明乙肝病毒基因发生了变异，也是需要积极进行抗病毒治疗，降低肝硬化及肝癌的发病危险。
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