恩替卡韦和替诺福韦都是全球各大乙肝指南推荐的一线抗病毒药物，专家认为，对于不同的乙肝患者，两种药物不能说谁更好，只能说谁更合适。恩替卡韦绝少耐药，绝少不良反应，其最突出的优势是长期使用的安全性很好。恩替卡韦和替诺福韦相比的弱势在于：抗病毒作用不如替诺福韦强大；与拉米夫定和替比夫定存在交叉耐药，如果既往有拉米夫定或者替比夫定的耐药经历，就不能再用恩替卡韦单药了；不能用于孕妇。
如果仅仅从抗病毒作用强弱来看，替诺福韦是真正的王者！它是人类目前已知的最强效的抗乙肝病毒药物，2008年上市以来，在与乙肝病毒无数次的拼杀中，始终保持不败的记录，零耐药率。替诺福韦的突出优势是抗病毒作用最强，零耐药率。替诺福韦几乎可以通吃所有耐药乙肝病毒，还可以用于孕妇。使用替诺福韦唯一的担心，就是担心它的肾脏损伤发生风险。对于年龄较大、有基础肾脏病、有糖尿病、高血压的患者，长期使用替诺福韦可能会增强肾脏损伤的风险。
需要怀孕的时候，用替诺福韦，平时维持治疗用恩替卡韦；有肾脏基础疾病或者同时合并高血压、糖尿病的乙肝患者，尽量首选恩替卡韦；既往拉米夫定或者替比夫定耐药的患者，应该首选替诺福韦；使用激素或者化疗药物等，担心恩替卡韦耐药，可以短时间换用替诺福韦，激素或化疗药物不用时，可以换回恩替卡韦，关键是合理应用，灵活掌握。
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