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在存在法匹拉韦(Favipiravir)的情况下传代的裂谷热病毒变化

时间:2022-12-04 12:30 来源:康安途 作者:康安途医疗宋萍

  特异性感染性的降低,突变谱的扩大以及病毒群体共识序列的不变性是致命诱变的诊断。为了探索这些参数,在不存在或存在40μM法匹拉韦的情况下,检查了第1至4代的RVFV群体。在法匹拉韦感染性和病毒RNA产生的变化导致在法匹拉韦存在的情况下传代的群体中特异性感染性逐渐降低(在四代中高达8倍),但在不存在的情况下则不然(P< 0.0001对于传代1至4;t检验)。因此,作用于裂谷热病毒的法匹拉韦符合致死性诱变的第一个诊断标准。

法匹拉韦

  在存在法匹拉韦(Favipiravir)的情况下传代的裂谷热病毒变化

  为了检查后代产量的减少是否与病毒RNA的诱变增加有关,在不存在或存在40μM法匹拉韦的情况下,从传代4的细胞培养上清液中提取总RNA,并提取编码包含核苷酸2091至3223的糖蛋白Gc区域的1.1 kb DNA片段(根据RVFV菌株SA-75的GenBank序列编号;基因银行入库编号)经逆转录酶PCR(RT-PCR)扩增,并进行分子克隆和核苷酸测序。对于每种情况(有/没有药物),总共分析了29个克隆,对应于测序的31,610个核苷酸(nt)。结果表明在法匹拉韦存在下,与复制相关的最小突变频率显着增加2.5倍(P< 0.0001; χ2测试)。在分析的群体中鉴定出的总共142个不同的突变中,89个仅在存在法匹拉韦的传代群体中检测到,4个仅在没有法匹拉韦的传代群体中检测到,49个在两个群体中常见(如补充材料的表S1所示)。

  一旦排除了常见突变,最小突变频率为 1.3 × 10−4和 2.8 × 10−3分别不存在和存在法匹拉韦,差异具有统计学意义(P< 0.0001; χ2测试)。分析Gc序列数量的分布是每个克隆突变数.虽然在没有药物的情况下传代的病毒群体产生了7个没有突变的克隆和7个只有一个突变的克隆(两种情况下均为24.1%),但只有1个没有突变的克隆和2个有1个突变的克隆从法匹拉韦存在下的传代群体中取出(分别为1/29,3.4%;2/29,6.9%)。

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(责任编辑:康安途医疗-目里里)
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