乙肝五项检查包括乙肝表面抗原（HBsAg）、乙肝表面抗体（抗HBS）、e抗原(HBeAg)、e抗体（抗-HBe）、核心抗体（抗-HBc）。乙肝表面抗原（HBsAg）是一种分泌性包膜蛋白，与肝细胞中ccDNA、总HBV-DNA相关，而ccDNA是病毒复制的模板并维持HBV的慢性感染状态，因此HBsAg可作为肝细胞感染HBV的一个重要标记物。血清中HBsAg的清除是欧洲肝病学会等慢性肝病防治指南中提出的理想治疗终点。值得注意的是尽管HBsAg携带者HBsAg自发性清除发生率约0.5%/年，抗病毒治疗的理想终点是HBsAg消失，但在HBsAg消失的个体中，有约一半以上者血清中仍可持续出现低水平HBVDNA。
乙肝表面抗体（抗HBS）是对乙肝病毒免疫的保护性抗体。一般由既往感染过乙肝病毒，但已经排除病毒，或者接种过乙肝疫苗，产生了保护性抗体，保护人体免受乙肝病毒再度袭击，是乙肝痊愈的标志。HBsAb对同型病毒的再感染有保护作用，可持续多年。e抗原(HBeAg)是乙肝病毒核心颗粒中的一种可溶性蛋白质。是乙肝病毒复制程度的标志。乙肝E抗原通常在血清中存在的时间较短，为3-6周，乙肝表面抗原在血内高峰期亦是乙肝e抗原的峰期。
多认为e抗原是判断乙肝治疗停药的重要标志。e抗体（抗-HBe）是人体感染乙肝病毒后，继乙肝核心抗体产生而出现的另一抗体，是乙肝病毒感染的又一标志物。乙肝五项检查中的乙肝e抗体并不是一种保护性抗体，e抗体的出现一般代表着乙肝病毒复制减少或已基本停止。一般来说，乙肝e抗体阳性预示患者的传染性已显着或相对降低。核心抗体（抗-HBc），它不是保护性抗体，它的存在反而是受到乙肝病毒侵害的指标之一。HBV感染后，在多数人血清中能检出此抗体，是一种敏感的血清学标志，也是乙型肝炎急性感染的早期标志。
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