乙肝最常见的检测是乙肝五项指标，乙肝表面抗原为乙肝病毒的蛋白质外壳，包绕在乙肝病毒最外层。单独的HBsAg并没有传染性，但它却能激发人体免疫功能产生抗HBs，—旦人的血液中存在大量的抗-HBs，就能保护人体不再感染乙肝。因此，乙肝疫苗中的主要成份就是HBsAg。HBeAg标志着乙肝病毒正在复制，有明显的传染性。与HBcAg对应的是抗-HBe，通过治疗及自身的免疫调节，病人血中HBeAg消失，被抗-HBe取代，这就叫HBcAg/抗-HBe血清学转换，标志着乙肝病毒复制的终止或仅有低度复制，传染性消失或有轻微的传染性。HBcAg它提示乙肝病毒的复制，与其对应的抗-HBc是经常检测的项目。抗-HBc分为两类，一类是抗-HBclgG，提示乙肝病毒既往感染，不易从血中消失；另一类是抗-HBcIgM，提示乙肝病毒新近感染或急性发作，过了急性期，抗-HBcIgM可消失，被抗-HBcIgG取代。
乙肝dna是判断乙肝病毒有无复制的金指标，乙肝dna称为乙肝病毒脱氧核糖核酸。病毒与细菌不同，细菌体内含有两种核酸(RNA和DNA)，而病毒体内只含有一种核酸，或RNA或DNA。核酸是病毒的核心部分、病毒的基因都在这里，没有核酸，病毒就不能复制。因此，检测HBV DNA是判断乙肝病毒有无复制的“金指标”。有人会问，检测乙肝五项指标已能反映乙肝病毒有无复制、有无传染性，为何还要检测HBV DNA呢？这是不是重复检查，增加了病人的负担？可以肯定，检测乙肝dna是必需的，不是重复检查。
如果乙肝病人是小三阳，一般说这是乙肝病毒进入非复制状态，传染性消失或很低，病情也应当趋于稳定。但实际情况并非如此，有时病人的转氨酶仍然反复波动，甚至出现黄胆，这是怎么回事？经检测乙肝dna发现其为阳性，可以肯定，病毒仍复制活跃、病情不稳定与乙肝病毒活跃有关。小三阳乙肝因其HBeAg阴性，被医生称为HBeAg阴性肝炎，是这由于病毒变异造成的。对此型乙肝不能掉以轻心，病情可能更重。在检测病人二对半时，仅发现其中1项阳性，如HBsAg阳性或单一的抗-HBc阳性，这并不能说明病人体内的病毒有无复制，必需检测乙肝dna，一旦阳性、就可肯定仍有病毒复制、也有传染性。有一些肝炎病人的“二对半”5项全部阴性，通过测乙肝dna后，可能发现为阳性，就此可断定这种肝炎叫慢性隐匿性乙肝，在不明原因的肝炎中，此类型肝炎约占30%-60%。
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