β-D-N4-羟基胞苷-5′-异丙酯(莫洛匹韦/莫诺拉韦)是一种口服生物利用度类似于瑞德西韦的NHC;这两种药物都通过模仿核糖核苷起作用;因此,莫洛匹韦/莫诺拉韦停靠在SARS-CoV-2的RdRp的瑞德西韦结合位点内。AutoDock仪器用于分子对接,将莫洛匹韦/莫诺拉韦对接到NSP12结合孔,在那里它通过在病毒RNA复制过程中提供拷贝错误来发挥其抗病毒靶标。
莫洛匹韦(Molnupiravir)/莫诺拉韦的内部构造机制的介绍
nsp12-nsp7-nsp8复合物含有镁2+和RNA催化离子。由瑞德西韦共结晶的PDB ID:7BV2。对于莫洛匹韦/莫诺拉韦对接研究,选择了相同的结合网格。配体和蛋白质是使用MGL仪器创建的。将Kollman和Hydrogens电荷附加到蛋白质中,然后加入到莫洛匹韦/莫诺拉韦,Gaisteger和氢电荷中以制备。
网格间距为0.375-Å的网格调整为X=42、Y=46和Z=52。此时,配体和蛋白质对接,并产生100个结合案例进行分析。为了进一步分析,选择了显示与主要催化剩余物相互作用的最佳结合案例。因此,对接确定了配体和复合物之间的相互作用。总体而言,与来自nsp12的65个残基的莫洛匹韦/莫诺拉韦相互作用。
如有药品相关问题咨询,请扫下方二维码添加专业医学顾问,我们7*24小时竭诚为您服务。
莫洛匹韦(Molnupiravir)/莫诺拉韦点击了解更多药品信息:https://www.kangantu.com/news/