目前很多患者会担心法匹拉韦的不良反应情况，实际上在试验中，有21 例患者 （60%） 经历了 SAE最常见的SAE是继发性细菌感染和急性肾损伤。给药组之间的SAE频率没有差异。5种SAE被认为可能与法匹拉韦有关。1800/800 mg组中的两名患者在第二剂法匹拉韦和奥司他韦后第2天出现谵妄，这被认为可能与药物或严重流感疾病有关。
法匹拉韦和奥司他韦在两名患者中继续使用，谵妄在第3天逆转，另一名在第4天逆转。1800/800 mg组血清尿酸水平显著升高（p< 0.05），但中位水平仍<430μmol/L.1600/600 mg组的两名患者和1800/800 mg组的一名患者在研究第2-4天的丙氨酸氨基转移酶（ALT）和天冬氨酸氨基转移酶（AST）水平升高，这被认为可能与法匹拉韦有关。然而，ALT和AST在继续使用法匹拉韦的同时都恢复正常。其他SAE均不被认为与法匹拉韦有关。
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